2023年7月,我院石德顺研究员团队在国际top期刊《Journal of Animal Science and Biotechnology》(中科院一区,IF=7.0)在线发表了题为“Whole-genome transcriptome and DNA methylation dynamics of pre-implantation embryos reveal progression of embryonic genome activation in buffaloes”的研究成果,首次从全基因组转录和DNA甲基化水平揭示了水牛早期胚胎发育进程,并揭示了胚胎基因组激活(EGA)机制。
水牛早期胚胎在体外培养发育率较低,容易发生发育阻滞现象,这极大的限制了水牛胚胎生物技术在水牛产业发展中的应用。因此,阐明水牛早期胚胎发育规律及EGA分子调控机制具有重要意义。本研究运用微量细胞RNA-Seq和WGBS技术,首次构建了水牛卵母细胞和早期胚胎全基因组转录图谱和DNA甲基化图谱,揭示了水牛早期胚胎进程,从全基因组水平明确了水牛Major EGA发生在16-cell阶段,通过WGCNA分析进一步阐述了水牛EGA的调控机制,明确了相关调控通路和重要hubgene,并且发现CDK1基因通过细胞周期、细胞分裂、磷酸化和蛋白质定位到核等细胞分子生物过程对水牛胚胎EGA起到了关键性作用。
本研究工作以龙8long8手机登录为第一通讯单位,龙8long8手机登录石德顺研究员和中国农科院深圳基因所高飞研究员为通讯作者,伏彭辉博士为第一作者,杨春艳博士、袁翔博士均参与了重要工作。该研究同时得到了刘庆友教授和崔奎青教授的倾心指导。项目得到国家自然基金项目和广西八桂学者创新团队项目资助。
全文链接:https://jasbsci.biomedcentral.com/articles/10.1186/s40104-023-00894-5
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